ДОПОЛНЕНИЕ К МУЗЫКЕ ГЕНОВ .БЕЛКОВЫЕ ДОМЕНЫ.МУЗЫКА ВИРУСА ГЕРПЕСА 2.
КУРНОСОВ М.Н.
АЛГОРИТМ МУЗЫКИ ГЕНОВ.БЕЛКОВЫЕ ДОМЕНЫ.

ДОПОЛНЕНИЕ К МУЗЫКЕ ГЕНОВ ОТ 24 ИЮЛЯ 2008-БЕЛКОВЫЕ ДОМЕНЫ.
ДОПОЛНЕНИЕ К МУЗЫКЕ ГЕНОВ ОТ 20 ЯНВАРЯ 2011-МУЗЫКА ВИРУСА ГЕРПЕСА ТИПА 2.

По просьбе людей,которые проявили интерес к музыке генов,
я раскрываю идею для алгоритма,который использовал для ее
создания. Идея в следующем: триплет нуклеотидов - универсальный
генетический код - одна аминокислота - одна нота октавы.
Для распределения всех 20 аминокислот по нотам я разделил их
по молекулярной массе,чем больше вес - тем ниже частота звука.

Отсканированный график этой зависимости прилагается.
Файл musgen.tif надо смотреть для WIN98- kodakimg.exe ,а
для WINXP и OFFICE2003 - mspview.exe ,другие смотрелки графики
хуже.

Каждая аминокислота соответствует одной ноте,а все они
охватывают 3 октавы.Хотя музыка полностью отражает химическую
структуру гена и его продукта,но все-таки распределение это
принято мной искусственно и этот перевод последовательности
нуклеотидов ДНК в последовательность звуков или нот выполнен без
связи с каким-то биологическим или физико-химическим процессом,
поэтому моя музыка генов не может оказать какого-то иного
влияния на организм,чем обычная музыка.Об этом и было написано
на моем сайте в 2006 году.

К тому же музыкальный файл охватывает весь ген или белок,а они
по своей длине имеют разное значение.Есть структурные,есть ре-
гуляторные участки,есть разные повторы.В ДНК информация белка
закодирована,на ДНК участки гена могут мало отличаться друг от
друга,а в кодируемом им белке будут очень разные структуры.
Белки состоят из различных регионов,доменов,сайтов или точек
имеющих функциональное значение.

Поэтому следующим моим шагом было, конечно, создание музыки генов
для отдельных белковых доменов.Для примера - белок спондин.
Ген расположен в 7 хромосоме - SSPO.Спондин нужен для нейрональной
агрегации в развитии нервной системы.Белок-предшественник очень
большой - молекулярная масса 547504 Д.Аминокислот - 5147.
Если перевести такое количество аминокислот в ноты,то файл
будет звучать около 10 минут.Хорошая же генная мелодия - короткая,
но оригинального звучания.В спондине много доменов и я их привожу
ниже.

SIGNAL 1 17 Potential.
CHAIN 18 5147 SCO-spondin.
DOMAIN 18 102 EMI.
DOMAIN 194 408 VWFD 1.
DOMAIN 469 524 TIL 1.
DOMAIN 563 773 VWFD 2.
DOMAIN 827 879 TIL 2.
DOMAIN 880 939 VWFC 1.
DOMAIN 1013 1219 VWFD 3.
DOMAIN 1275 1331 TIL 3.
DOMAIN 1375 1412 LDL-receptor class A 1.
DOMAIN 1415 1450 LDL-receptor class A 2.
DOMAIN 1451 1487 LDL-receptor class A 3.
DOMAIN 1491 1529 LDL-receptor class A 4.
DOMAIN 1564 1600 LDL-receptor class A 5.
DOMAIN 1602 1641 LDL-receptor class A 6.
DOMAIN 1655 1693 LDL-receptor class A 7.
DOMAIN 1694 1748 TSP type-1 1.
DOMAIN 1750 1808 TSP type-1 2.
DOMAIN 1824 1863 EGF-like 1.
DOMAIN 1864 1901 EGF-like 2.
DOMAIN 1909 1965 TSP type-1 3.
DOMAIN 1965 2025 VWFC 2.
DOMAIN 2065 2224 F5/8 type C.
DOMAIN 2233 2269 LDL-receptor class A 8.
DOMAIN 2390 2426 LDL-receptor class A 9.
DOMAIN 2463 2499 LDL-receptor class A 10.
DOMAIN 2500 2553 TSP type-1 4.
DOMAIN 2555 2610 TSP type-1 5.
DOMAIN 2633 2675 TIL 4.
DOMAIN 2715 2769 TSP type-1 6.
DOMAIN 2772 2828 TSP type-1 7.
DOMAIN 2830 2883 TSP type-1 8.
DOMAIN 2985 3040 TSP type-1 9.
DOMAIN 3041 3083 TSP type-1 10.
DOMAIN 3183 3250 TSP type-1 11.
DOMAIN 3252 3307 TSP type-1 12.
DOMAIN 3311 3365 TIL 5.
DOMAIN 3408 3470 TSP type-1 13.
DOMAIN 3472 3527 TSP type-1 14.
DOMAIN 3645 3693 TSP type-1 15.
DOMAIN 3811 3932 TSP type-1 16.
DOMAIN 3946 4002 TSP type-1 17.
DOMAIN 4004 4059 TSP type-1 18.
DOMAIN 4159 4212 TSP type-1 19.
DOMAIN 4253 4305 TSP type-1 20.
DOMAIN 4307 4363 TSP type-1 21.
DOMAIN 4365 4419 TSP type-1 22.
DOMAIN 4615 4665 TSP type-1 23.
DOMAIN 4667 4723 TIL 6.
DOMAIN 4763 4816 TSP type-1 24.
DOMAIN 4984 5042 VWFC 3.
DOMAIN 5041 5140 CTCK.

Для примера домен 1864-1901 это участок белка, подобный
эпидермальному фактору роста - EGF-like 2,и для таких коротких,
но функционально-значимых мест есть решение создать звуковой
файл.Не обязательно звук,любой волновой паттерн.

Как было написано мной на сайте ранее все эти звуковые файлы
создаются для возможного в будущем инструктирования микроботов
или наноботов.Цель - точковый мутагенез в участках ДНК,кодиру-
ющих белковые домены.

Фармакология белковых доменов - это фармакология не далекого
будущего,эта область биотехнологии очень интенсивно развивается.
На основе 2 и 3 структур белковых доменов подбираются молекулы
для избирательной модификации активных участков белка.
Уникальность,консервативность и специфичность некоторых доменов
очень велика,например активный центр фермента связывает и изменяет
только один тип молекул из десятков тысяч других и почти одинаковы
у человека и мыши.

Для тех ,кто интересуется ,могу выслать базы белков и белковых
доменов всех белков человека и других организмов.
На полном СД есть 4 базы для человека,закаченых с разных гене-
тических серверов,они дополняют друг друга.С моими пояснениями,
так как даже врачам других специализаций будет возможно не ясно
что к чему.Цена диска 300 рублей,и ВЫ экономите много средств и
времени.Заказ будет оформлен как интернет-услуга с квитанцией.
Как и ранее с людьми работаю только лично без посредников.
Все полученные деньги идут только на науку.

Заказ на z1959z@yandex.ru Курносову М.Н.
рисунок для алгоритма
МУЗЫКА ГЕНОВ ВИРУСА ГЕРПЕСА ТИПА 2
 

Hosted by uCoz